Complete Range of the Universal mtDNA Gene Pool and High Genetic Diversity in the Thai Dog Population.

Populacja psów w Azji Południowo-Wschodniej jest wyjątkowa pod względem posiadania praktycznie pełnego zakresu uniwersalnej puli genów mtDNA, a co za tym idzie, ma największą różnorodność genetyczną na świecie. Mimo to w tym regionie przeprowadzono ograniczone badania nad genetyką psów. Tutaj przedstawiamy pierwsze kompleksowe badanie podregionu w Azji Południowo-Wschodniej, analizujące 528 pz mtDNA dla 265 psów z Tajlandii, w kontekście psów z całego Starego Świata. Odkryliśmy, że Tajlandia była jedynym regionem na świecie, który ma pełny zakres uniwersalnej puli genów mtDNA, czyli wszystkie 10 podhaplogrup. W związku z tym statystyki dotyczące różnorodności należą do najwyższych, zwłaszcza w północnej Tajlandii, która miała wysokie wartości haplotypuróżnorodności i liczby haplotypów oraz najniższy wśród wszystkich regionów odsetek osobników z uniwersalnym haplotypem typu typ-derived (UTd).
  • Jak wcześniej zaobserwowano, różnorodność genetyczna jest wyraźnie niższa poza Azją Południowo-Wschodnią i zmniejsza się wraz z tendencją do najniższych wartości w zachodniej Eurazji.
  • Tak więc ograniczony region geograficzny Tajlandii ma wyraźnie wyższą różnorodność genetyczną niż znacznie większe regiony w zachodniej Eurazji, na przykład Azja Południowo-Zachodnia i Europa, które mają odpowiednio tylko pięć i cztery z 10 podhaplogrup.
  • W Tajlandii statystyki dotyczące różnorodności dla wszystkich czterech podregionów są zgodne z ogólnym wzorcem Azji Południowo-Wschodniej, ale Tajlandia Północna wyróżnia się dużym zróżnicowaniem w porównaniu z innymi regionami.
  • Wyniki te pokazują, że niewielka część Azji Południowo-Wschodniej posiada pełny zakres puli genów mtDNA i podkreślają wyjątkowy status genetyczny Azji Południowo-Wschodniej.
  • Wskazuje to, że dzisiejsze psy mogą wywodzić znaczną część swoich przodków z Azji Południowo-Wschodniej lub z blisko położonych regionów, co podkreśla Tajlandię jako region o szczególnym znaczeniu.
  • Biorąc pod uwagę dużą różnorodność genetyczną znalezioną w Tajlandii oraz fakt, że wiele sąsiednich regionów, np. Myanmar i Laos, nie zostało zbadanych pod kątem genetyki psów, możliwe jest, że duża część puli genów psów pozostaje nieodkryta. Wypełnienie tych pustych miejsc na mapie filogeograficznej będzie ważnym zadaniem dla przyszłych badań.
Dog Universal Reference cDNA-Oligo
Dog Universal Reference cDNA-Oligo

Ocena CTAD (cytrynian-teofilina-adenozyna-dipirydamol) jako  uniwersalnego  antykoagulanta u  psów .

Wykazano, że CTAD (cytrynian-teofilina-adenozyno-dipirydamol) jest niemal uniwersalnym antykoagulantem w medycynie ludzi i kotów, umożliwiającym większość analiz hematologicznych, koagulacyjnych i biochemicznych. Czterdzieści próbek krwi psa pobrano za pomocą CTAD, EDTA, heparyny i cytrynianu do analiz hematologicznych, biochemicznych i krzepnięcia. CTAD częściowo ogranicza agregację płytek krwi obserwowaną w rozmazach krwi EDTA. Próbki CTAD dały podobne i dobrze skorelowane wyniki dla większości zmiennych pełnej liczby krwinek, z wyjątkiem średniej objętości krwinki, która była umiarkowanie wyższa i średniego stężenia hemoglobiny w krwince, które było umiarkowanie niższe w CTAD niż w EDTA; Wskaźniki retikulocytów i płytek krwi były słabo skorelowane.
Osocze CTAD dało podobne wyniki jak cytrynian dla fibrynogenu, antytrombiny i D-dimerów oraz stosunkowo podobne wyniki dla czasu protrombinowego, ale czas częściowej tromboplastyny ​​po aktywacji był słabo skorelowany. Triglicerydy, cholesterol, glukoza, białka całkowite, fosforany, żelazo, aminotransferaza alaninowa, transferaza γ-glutamylowa i lipaza były podobne i dobrze skorelowane w osoczu CTAD i heparyny.
Mocznik, kreatynina, albumina, fosfataza alkaliczna, amylaza i aminotransferaza asparaginianowa wykazywały odchylenie od umiarkowanego do wyraźnego, ale zmienne te można było zmierzyć w osoczu CTAD, jeśli określono nowe przedziały referencyjne. Pomiary aktywności kinazy kreatynowej, potasu, chlorków i całkowitego dwutlenku węgla nie są zalecane w osoczu CTAD. CTAD jest potencjalnym kandydatem jako niemal uniwersalny antykoagulant do rutynowej hematologii, niektórych czynników krzepnięcia osocza i wielu zmiennych biochemicznych u psów. Ostateczne zalecenia będą wymagały zbadania nieprawidłowych próbek krwi psów.

Testy oparte na 16S rRNA do ilościowego wykrywania  uniwersalnych , swoistych dla ludzi, krów i  psów bakterii kałowych: podejście bayesowskie

Przedstawiamy projekt i walidację nowych testów TaqMan(R) do śledzenia źródła drobnoustrojów w oparciu o amplifikację sekwencji markerowych 16S rRNA kału z niehodowanych komórek z rzędu Bacteroidales. Testy zostały opracowane do wykrywania i zliczania niepunktowego źródła zanieczyszczenia kałem do zlewni. W ilościowym „uniwersalnym” teście Bacteroidales BacUni-UCD wykryto wszystkie badane próbki kału od ochotników (18 z 18), kota (7 z 7), psa (8 z 8), mewy (10/10), krowy ( 8/8), konie (8/8) i ścieki (14/14). Ludzki test BacHum-UCD w pełni rozróżniał próbki kału ludzkiego i krowiego, ale nie wykrył wszystkich próbek kału od ludzkich ochotników (12/18). Ponadto wykryto 12,5% psiego stolca (1/8), ale nie stwierdzono reaktywności krzyżowej z próbkami kału kota, konia lub mewy.
W przeciwieństwie do tego, wszystkie próbki ścieków były pozytywne pod względem markera BacHum-UCD, co potwierdza jego oznaczenie jako w 100% wrażliwe na identyfikację źródła mieszanych ludzi. Specyficzny dla krów test BacCow-UCD w pełni rozróżniał próbki kału krowiego i ludzkiego. Wykryto 38% końskiego kału (3/8), ale nie stwierdzono krzyżowej swoistości z żadną z innych badanych próbek kału zwierzęcego. Test dla psów BacCan-UCD w pełni rozróżniał próbki kału psa i krowy lub guano mewy i wykrył 62,5% próbek kału od psów (5/8). Wystąpiła pewna reaktywność krzyżowa z 22,2% wykryciem ludzkiego kału (4/18), 14,3% wykryciem kału kota (1/7) i 28,6% wykryciem próbek ścieków (4/14).
Po walidacji przy użyciu próbek kału zastosowano testy z pojedynczą ślepą próbą, aby dodatkowo wykazać skuteczność opracowanych markerów; wszystkie testy były czułe, powtarzalne i dokładne w oznaczaniu ilościowym mieszanych źródeł kału obecnych w próbkach wodnych. Wreszcie, nowe testy porównano z wcześniej opublikowanymi sekwencjami, co wykazało, że nowe metodologie są bardziej specyficzne i czułe. Korzystając z twierdzenia Bayesa, obliczyliśmy warunkowe prawdopodobieństwo, że cztery testy poprawnie zidentyfikują ogólne i specyficzne dla gospodarza zanieczyszczenie kałem w określonym zlewni w Kalifornii, dla której przeanalizowano 73 próbki wody.
Takie podejście pozwala na bezpośrednie porównanie skuteczności różnych metod MST, w tym opartych na metodologiach zależnych od bibliotek. W przypadku uniwersalnego markera BacUni-UCD prawdopodobieństwo wystąpienia zanieczyszczenia kałem po wykryciu markera wynosiło 1,00; prawdopodobieństwo obecności zanieczyszczenia specyficznego dla gospodarza wynosiło odpowiednio 0,98, 0,84 i 0,89 dla testu na ludziach HF160F, testu dla krów BacCow-UCD i testu dla psów BacCan-UCD. Zastosowanie tych znaczników powinno dostarczyć istotnych informacji, które pomogą w wysiłkach zmierzających do identyfikacji i kontroli źródeł zanieczyszczenia kałem uszkodzonych zlewni.

Wydzielanie kwasu po wagotomii i przepływ krwi przez błonę śluzową podczas stymulacji receptorów beta-adrenergicznych i  powszechna  sympatektomia chemiczna u  psów .

Celem niniejszej pracy było zbadanie wpływu stymulacji receptorów beta-adrenergicznych, blokady alfa i eliminacji funkcji nerwu adrenergicznego na przepływ krwi w błonie śluzowej i wydzielanie kwasu u psów z przetoką żołądkową po wagotomii komórek okładzinowych (PCV). Izoprenalina hamowała stymulowane pentagastryną wydzielanie kwasu żołądkowego za pośrednictwem receptorów beta 1 w sposób niekonkurencyjny. Wpływ izoprenaliny był wyraźniejszy po wagotomii niż przed wagotomią i znacznie wyraźniejszy niż wpływ na wydzielanie kwasu żołądkowego stymulowane parasympatykomimetycznie (betanochol).

Universal cDNA Reverse Transcribed by Oligo dT Primer: Dog Normal Tissues

C4734565 Biochain 100 reactions 295 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Oligo dT Primer: Human Normal Tissues

C4234565 Biochain 100 reactions 295 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Oligo dT Primer: Mouse Normal Tissues

C4334566 Biochain 100 reactions 295 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Oligo dT Primer: Rat Normal Tissues

C4434567 Biochain 100 reactions 295 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Oligo dT Primer: Monkey Normal Tissues

C4534565 Biochain 100 reactions 295 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Oligo dT Primer: Chicken Normal Tissues

C4C34565 Biochain 100 reactions 295 EUR

200UL "MAXYMUM RECOVERY" UNIVERSAL FIT REFERENCE TIPS

TR-222-C-L CORNING 1000/pk 248 EUR

200UL "MAXYMUM RECOVERY" UNIVERSAL FIT REFERENCE TIPS, RACKED

TR-222-C-L-R CORNING 960/pk 156 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Random Hexamer: Dog Normal Tissues

C4734565-R Biochain 100 reactions 295 EUR

200UL YELLOW, STERILIZED UNIVERSAL FIT PIPET TIPS WITH REFERENCE LINES

TR-222-Y-R-S CORNING 960/pk 140 EUR

200UL "MAXYMUM RECOVERY" UNIVERSAL FIT REFERENCE TIPS, RACKED AND PRE-STERILIZED

TR-222-C-L-R-S CORNING 960/pk 192 EUR

200UL CLEAR MAXYMUM RECOVERY UNIVERSAL FIT PIPET TIPS WITH REFERENCE LINES

TR-222-C-L-STK CORNING 480/pk 135 EUR

Chicken (Normal/Adult) Universal (pool of tissue cDNA)

CHUC-565 Alpha Diagnostics 10 rxn 415 EUR

200UL CLEAR, MAXYMUM RECOVERY STERILE UNIVERSAL FIT PIPET TIPS WITH REFERENCE LINES

TR-222-C-STK-S CORNING 480/pk 132 EUR

amfiRivert cDNA Synthesis Platinum Master Mix, Oligo dT/Random Hexamer

R5600-050 GenDepot 50 rxns 235 EUR

amfiRivert cDNA Synthesis Platinum Master Mix, Oligo dT/Random Hexamer

R5600-100 GenDepot 2X50 rxns 381 EUR

amfiRivert cDNA Synthesis Platinum Master Mix, Oligo dT/Random Hexamer

R5600-200 GenDepot 4x50 rxns 658 EUR

amfiRivert cDNA Synthesis Platinum Master Mix, Oligo dT/Random Hexamer

R5600-500 GenDepot 10X50 rxns 1333 EUR

Dog Adult Tissues Protein lysate, Universal

DOUL-4568 Alpha Diagnostics 1 mg 524 EUR

Universal Protein Lysate: Dog Normal Tissues

P4734565 Biochain 4x0.5 mg 403 EUR

Universal Protein Lysate: Dog Normal Tissues

P4734565-1 Biochain 2x0.5 mg 285 EUR

Universal RNA from Dog Normal Tissues

R4734565 Biochain 4x100 ug 628 EUR

Universal RNA from Dog Normal Tissues

R4734565-1 Biochain 2x100 ug 390 EUR

200UL CLEAR PRE-STERILIZED MAXYMUM RECOVERY UNIVERSAL FIT PIPET TIPS WITH REFERENCE LINES

TR-222-C-L-STK-S CORNING 480/pk 154 EUR

Itraconazole Reference Standard

50R-R51211 Fitzgerald 50 mg 133 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Random Hexamer: Human Normal Tissues

C4234565-R Biochain 100 reactions 295 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Random Hexamer: Mouse Normal Tissues

C4334566-R Biochain 100 reactions 295 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Random Hexamer: Rat Normal Tissues

C4434567-R Biochain 100 reactions 295 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Random Hexamer: Monkey Normal Tissues

C4534565-R Biochain 100 reactions 295 EUR

Universal cDNA Reverse Transcribed by Random Hexamer: Chicken Normal Tissues

C4C34565-R Biochain 100 reactions 295 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Bladder

C1734010 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Brain

C1734035 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Cecum

C1734089 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Esophagus

C1734106 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Heart

C1734122 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Kidney

C1734142 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Liver

C1734149 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Lung

C1734152 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Trachea

C1734160 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Pancreas

C1734188 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Rectum

C1734206 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Stomach

C1734248 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Testis

C1734260 Biochain 40 reactions 376 EUR

hTransferrin Reference Antigen Concentrate

F037RAC Cygnus Technologies 1 ml 411 EUR

Fluorescein Reference Dye (100X)

F553 GeneOn 1 ml (10µM) 61 EUR

Fluorescein Reference Dye (100X)

F553L GeneOn 5x1 ml (50µM) 172 EUR

Rox Passive Reference Dye

R1000-500 GenDepot 500ul 115 EUR

200UL CLEAR REFERENCE TIPS

TR-222-C CORNING 1000/pk 213 EUR

200UL YELLOW REFERENCE TIPS

TR-222-Y CORNING 1000/pk 213 EUR

ROX passive reference dye

29052 Biotium 5mL 195 EUR

Oligo(dT)12

O1023-010 GenDepot 10ug 107 EUR

Oligo(dT)12

O1023-050 GenDepot 50ug 228 EUR

Oligo(dT)18

O1024-010 GenDepot 10ug 101 EUR

Oligo(dT)18

O1024-050 GenDepot 50ug 209 EUR

Oligo (dT) 18

BIO-38029 Bioline 27µg Ask for price

UNIVERSAL PLATFORM

480144 CORNING 1/pk 269 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Skeletal Muscle

C1734171 Biochain 40 reactions 376 EUR

cDNA from Dog Normal Tissue: Small Intestine

C1734226 Biochain 40 reactions 376 EUR

200UL CLEAR REFERENCE TIPS, RACKED

TR-222-C-R CORNING 960/pk 121 EUR

200UL YELLOW REFERENCE TIPS, RACKED

TR-222-Y-R CORNING 960/pk 134 EUR

I27O™ AFM Reference Protein

304 AthenaES 100 µg 483 EUR

Oligo(dT)15 (1DA)

S140 GeneOn 30 µg 46 EUR

Oligo(dT)12-18

O1025-010 GenDepot 10ug 112 EUR

Oligo(dT)12-18

O1025-050 GenDepot 50ug 246 EUR

Oligo(dT)18 Primer

G140 ABM 1.0OD, 500 ¦Ìl, 10 ¦ÌM 108 EUR

Universal qPCR Mixture

QPCR1000-UNIV Bio Basic 4X1.25ml 276.2 EUR

Universal Neutralization Buffer

NB001 Neuromics 100 ml 135 EUR

Universal Coating Solution

AC002 Neuromics 20 ml 297 EUR

Universal Detachment Solution

AD002 Neuromics 100 ml 148 EUR

Universal Spring Platform

H1000-P-SP Benchmark Scientific 1 PC 323.39 EUR

UNIVERSAL BEER AGAR

U21-100-10kg Alphabiosciences 10 kg 1524 EUR

UNIVERSAL BEER AGAR

U21-100-2kg Alphabiosciences 2kg 370 EUR

UNIVERSAL BEER AGAR

U21-100-500g Alphabiosciences 500 g 137 EUR

UNIVERSAL PREENRICHMENT BROTH

U21-101-10kg Alphabiosciences 10 kg 749 EUR

UNIVERSAL PREENRICHMENT BROTH

U21-101-2Kg Alphabiosciences 2 Kg 202 EUR

UNIVERSAL PREENRICHMENT BROTH

U21-101-500g Alphabiosciences 500 g 91 EUR

ROX Reference Dye (25 µM; 50x)

F153 GeneOn 1 ml 61 EUR

ROX Reference Dye (25 µM; 50x)

F153L GeneOn 5x1 ml 172 EUR

Human TDP1 Assay Kit (Oligo)

TG1004-1 TopoGen 100 assays 436 EUR

Human TDP1 Assay Kit (Oligo)

TG1004-2 TopoGen 250 assays 560 EUR

Oligo Modification Phosphoramidite: 5'-FAM

AHP-CH-5FAM008 Allele Biotech 85mg Ask for price

Oligo Modification Phosphoramidite: 5'-FAM

AHP-CH-5FAM100 Allele Biotech 1000 mg Ask for price

Universal Protein Precipitating Reagent

BSP012 Bio Basic 100preps 81.32 EUR

PCR plate-foil universal

A28216 GeneOn 1x100 pcs 94 EUR

PCR plate-foil universal

A28216L GeneOn 5x100 pcs 310 EUR

Universal Full Growth Medium

TM001 Neuromics 500 ml 336 EUR

Universal Casein Diluent/Blocker

85R-108 Fitzgerald 250 ml 230 EUR

5min Universal Ligation Mix

C311-01 Vazyme 50 rxn 214 EUR

5min Universal Ligation Mix

C311-02 Vazyme 100 rxn 283 EUR

200UL CLEAR REFERENCE TIPS IN STACKED RACKS

TR-222-C-STK CORNING 480/pk 121 EUR

200UL YELLOW REFERENCE TIPS IN STACKED RACKS

TR-222-Y-STK CORNING 480/pk 121 EUR

Mouse C3 reference serum (~10 ug/ml)

6230-RS Alpha Diagnostics 1 ml 202 EUR

ROX reference dye for qPCR, 1 mL

41110 Lumiprobe 1 mL 52 EUR

Vitamin A Reference Standard (USP grade powder)

51R-U716002 Fitzgerald 10 pack 516 EUR

ROX reference dye for qPCR, 500 uL

31110 Lumiprobe 500 uL 46 EUR

Oligo (dT)20 Coated Gold Particles

OdT(20)AuP-002-1 Spherotech 1 mL 385 EUR

Oligo (dT)20 Coated Gold Particles

OdT(20)AuP-002-5 Spherotech 5 mL 1045 EUR

Oligo (dT)25 Coated Gold Particles

OdT(25)AuP-002-1 Spherotech 1 mL 385 EUR

Oligo (dT)25 Coated Gold Particles

OdT(25)AuP-002-5 Spherotech 5 mL 1045 EUR

Oligo (dT)25 Coated Polystyrene Beads

OdT25P-100-4 Spherotech 4 mL 411 EUR
Zwierzęta poddano chemicznej sympatektomii z użyciem 6-hydroksy-dopaminy, fałszywego neuroprzekaźnika, który selektywnie niszczy adrenergiczne zakończenia nerwowe. Sympatektomia chemiczna zwiększyła stymulowane pentagastryną wydzielanie kwasu żołądkowego i ustabilizowała śluzówkowy przepływ krwi na poziomie sprzed wagotomii, ale ze zwiększonym stosunkiem przepływu krwi do wydzielania kwasu. Można stwierdzić, że układ nerwowy współczulny wpływa na czynność żołądka po wagotomii.

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.